一、表現癥狀不同
（一）果樹花葉病是一種病毒病，樹葉呈現各種類型的斑駁狀。典型的病癥是沿葉脈退綠變黃，其余部分仍為綠色。發病輕時，葉片局部散生淡黃色或黃白色大小不等的零星花斑，不形成壞死斑；發病較重時，沿葉脈變色，出現白色或黃白色的壞死斑，其中葉脈變色較明顯，葉片呈黃色網紋狀；發病嚴重時，全葉成為黃綠相間的花斑，沿葉脈變色，斑塊壞死，其中大型斑塊占多數。
（二）果樹黃葉病是由于植物組織內鐵的缺乏而造成的一種生理性病害。其癥狀是先從果樹新梢的頂端嫩葉開始變黃，越往枝節下端，老葉黃葉現象越輕。缺鐵輕微時，葉片葉肉變黃，葉脈兩側仍為綠色，呈綠色網紋狀；缺鐵嚴重時，葉片失綠加重，變成白色，并在失綠部分出現銹褐色枯斑或葉緣變得焦枯，引起落葉。
二、發病機制不同
（一）果樹花葉病的病毒存在于果樹根、枝、花、葉、果實中，破壞果樹內部組織正常的新陳代謝，致使其營養物質和能量分別合成病毒的蛋白質及核酸，從而影響植物組織內部蛋白質和核酸的正常形成，而使植物組織出現病態。
（二）果樹黃葉病是由于土壤中可溶性二價鐵轉化成不溶性三價鐵沉淀，使果樹組織內缺鐵，從而影響葉綠素的形成，使葉片失綠。這時只要及時補充可溶性二價鐵，癥狀很快就會消失。
三、防治方法不同
（一）果樹花葉病。生產上，有效的預防方法是選用無病砧木和接穗繁殖苗木，及時挖除圃內病株，加強肥水管理，增施有機肥，并在葉面噴施新高脂膜提高各類營養元素的吸收，增強樹勢。
（二）果樹黃葉病。注意增施有機肥改良土壤，壓堿抗旱，及時排澇，發芽前每株施硫酸亞鐵100～150克；嫩葉期噴施0．3％～0．5％的硫酸亞鐵溶液或氨基酸鐵300倍液各一次，防治效果良好。